Nee, deelname aan de Gezondheidsmonitor Jeugd is vrijwillig en de antwoorden worden strikt vertrouwelijk behandeld en verwerkt. Iedere leerling mag er (in overleg met zijn of haar ouders) voor kiezen om niet mee te doen. Er wordt een brief verstuurd met naar de ouders en leerlingen met instructies voor het afmelden.